Bioinformatics Centre
College of Veterinary Science, Assam Agricultural University, Guwahati-781022, India

Serotype MPGT Codes O Group O Antigen H Antigen Phase 1 H Antigen Phase 2 Others Experimentally Confirmed in-silico Derived 3,10:e,h:- 00000-0110-011-001 4,[5],12:i:- 11010-0110-011-101 6,7:k:- 00000-0100-111-001 S. bongori 00000-0110-001-000 11001-0110-000-000 00000-0000-000-000 Abony 11000-0100-100-001 O:4 (B) 1,4,[5],12,27 b e,n,x Abortusovis 01000-0101-101-100 01000-0100-101-100 O:4(B) 4,12 c 1,6 Adelaide 00000-0100-000-001 O:35(B) 35 f,g - [z27] Agona 01000-0100-001-001 O:4(B) 1,4,[5],12 f,g,s [1,2] [z27],[z45] Alachua 00000-0100-011-101 00010-0100-010-001 O:35(O) 35 z4,z23 - [z37],[z45] Albany 00000-0100-011-001 O:8(C2-C3) 8,20 z4,z24 - [z45] Anatum 00000-0110-111-001 O:3,10(E1) 3,{10},{15},{15,34} e,h 1,6 [z64] Anatum var. O 15+ (Newington) 00000-0110-111-001 Anatum var. O 15+,34+ (Minneapolis) 00000-0110-111-001 Aqua 00000-0110-110-101 O:30(N) 30 k 1,6 Arizonae 00000-0100-011-000 10000-0100-011-000 Baildon 00001-0110-100-001 O:9,46(D2) 9,46 a 1,2 Bardo 00000-0110-111-001 O:8(C2-C3) 8 e,h 1,2 Berta 01001-0100-011-101 O:9(D1) 1,9,12 [f],g,[t] - Blockley 01000-0110-110-001 O:8(C2-C3) 6,8 k 1,5 [z58] Bovismorbificans 01000-0100-011-001 O:8(C2-C3) 6,8,20 r,[i] 1,5 [R1.....] Braenderup 01011-0111-110-111 01000-0100-110-001 O:7(C1), 6,7,14, e,h, e,n,z15, Brandenburg 00000-0110-000-001 O:4(B) 4,[5],12 l,v e,n,z15 Bredeney 00100-0110-010-001 O:4(B) 1,4,12,27 l,v 1,7 [z40] Cerro 00000-0100-000-001 11000-0100-011-001 O:18(K) 6,14,18 z4,z23 [1,5] [z45],[z82] Choleraesuis 01000-0101-110-001 01000-0100-110-001 O:7 (C1) 6,7 c 1,5 Cubana 00000-0100-011-001 O:13(G) 1,13,23 z29 - [z37].[z43] Derby 00000-0110-011-101 O:4(B) 1,4,[5],12 f,g [1,2] Diarizonae 00000-0110-100-000 00001-0110-100-100 00000-0110-000-000 Dublin 00001-0100-011-101 01001-0111-111-101 O:9 (D1), 1,9,12,[Vi] g,p, Enteritidis 00001-1100-011-101 00001-0100-010-001 00001-0100-010-101 00011-0100-011-001 O:9 (D1) [1],9,12 g,m Fresno 00001-0100-011-001 O:9,46(D2) 9,46 z38 - Gallinarum 00000-0110-101-001 00001-0100-011-101 O:9 (D1) 1,9,12 - - Gallinarum var. Pullorum 00001-0110-010-101 00001-0100-010-101 1,9,12 Gaminara 00100-0100-010-001 O:16 (I) 16 d 1,7 Give 00000-0110-010-001 O:3,10(E1) 3,{10},{15},{15.34} l,v 1,7 [d],[z27] Give var. O 15+ (Newbrunswick) 00100-0110-010-001 Hadar 01000-0100-111-001 O:8(C2-C3) 6,8 z10 e,n,x Hartford 01000-0100-110-001 O:7(C1) 6,7 y e,n,x [z67] Havana 00000-0100-001-001 O:13(G) 1,13,23 f,g,[s] - [z79] Heidelberg 11000-0110-111-111 01000-0100-110-101 11000-0110-110-111 O:4 (B) 1,4,[5],12 r 1,2 Houtenae 01000-1100-010-000 10000-0110-010-100 00000-0110-000-000 Hvittingfoss 00000-0100-111-001 O:16(I) 16 b e,n,x Idikan 00001-0101-111-001 O:13 (G) 1,3,23 i 1,5 Indica 00000-0100-110-000 00000-0100-110-101 Infantis 00000-0100-100-011 00000-0100-110-001 00010-0100-110-011 O:7 (C1) 6,7,14 r 1,5 [R1....],[z37],[z45],[z49] Inverness 00000-0110-110-101 O:38 (P) 38 k 1,6 Javiana 00001-0110-100-001 O:9 (D1) 1,9,12 1,z28 1,5 [R1....] Johannesburg 00000-0110-110-000 O:40 (R) 1,40 b e,n,x Kentucky 00000-0100-010-011 01000-0101-111-001 01000-0100-111-001 O:8 (C2-C3) 8,20 i z6 Kiambu 00000-0100-100-001 O:4 (B) 1,4,12 z 1,5 Kintambo 00000-0110-010-001 01100-0100-001-001 O:13 (G) 1,13,23 m,t - Krefeld 01000-0110-111-011 O:1,3,19 (E4) 1,3,19 y l,w Lille 00000-0100-011-101 O:7 (C1) 6,7,14 z38 - [z82] Litchfield 11001-0110-111-001 00000-0110-111-001 O:8 (C2-C3) 6,8 l,v 1,2 Livingstone 00000-0100-100-001 O:7 (C1) 6,7,14 d l,w London 00000-0110-110-001 O:3,10 (E1) 3,{10},{15} l,v 1,6 Manhattan 01000-0110-100-001 O:8 (C2-C3) 6,8 d 1,5 [z58] Mbandaka 00000-0100-111-101 O:7 (C1) 6,7,14 z10 e,n,z15 [z37],[z45] Meleagridis 01000-0110-110-001 O:3,10 (E1) 3,{10},{15},{15,34} e,h l,w Miami 00001-0100-110-100 00101-0110-100-001 O:9 (D1) 1,9,12 a 1,5 Minnesota 00000-0110-110-001 O:21 (L) 21 b e,n,x [z33],[z49] Mississippi 00100-0110-110-000 O:13 (G) 1,13,23 b 1,5 Montevideo 00000-0100-010-001 00000-0110-110-000 00010-0100-010-000 00110-0100-010-000 00110-0100-010-001 O:54 6,7,14,54 g,m,s - Muenchen 00000-0100-111-001 01000-0110-110-001 O:8 (C2-C3) 6,8 d 1,2 [z67] Muenster 00000-0110-110-011 O:3,10 (E1) 3,{10},{15},{15,34} e,h 1,5 [z48] Newport 00001-0110-111-001 00000-0110-111-001 01000-0110-111-001 O:8(C2-C3) 6,8,[20] e,h 1,2 [z67],[z78] Nitra 00001-1100-011-101 O:2 (A) 2,12 g,m - Ohio 00000-0100-110-001 O:7 (C1) 6,7,14 b l,w [z59] Oranienburg 11000-0100-011-001 O:7 (C1) 6,7,14 m,t [z57] Orion 00010-0110-100-000 O:3,10 (E1) 3,{10},{15},{15,34} y 1,5 Orion var. O 15+ (Binza) 00010-0110-100-000 Ouakam 00001-0100-011-001 O:9,46(D2) 9,46 z29 - [z45] Panama 00001-0110-110-001 O:9 (D1) 1,9,12 l,v 1,5 [R1.....] Paratyphi A 10101-0111-100-010 00101-1101-011-101 00101-0110-100-010 O:2 (A) 1,2,12 a [1,5] Paratyphi B 11000-0110-110-001 01000-0110-010-001 01100-0100-010-001 11000-0100-100-101 O:4 (B) 1,4,[5],12 b 1,2 [z5],[z33] Paratyphi C 01000-0101-110-001 01000-0101-110-000 01000-0100-110-001 O:7 (C1) 6,7,[Vi] c 1,5 Poano 00000-0100-100-001 00100-0100-100-001 O:6,14 (H) [1],6,14,[25] z l,z13,z28 Pomona 00100-0100-110-000 O:28 (M) 28 y 1,7 [z80],[z90] Poona 00100-0110-100-011 O:13 (G) 1,13,22 z 1,6 [z44],[z59] Putten 00000-0100-110-001 O:13 (G) 13,23 d l,w Reading 11000-0110-110-101 O:4(B) 1,4,[5],12 e,h 1,5 [R1......] Rissen 11000-0100-011-001 O:7 (C1) 6,7,14 f,g - Rubislaw 00000-0110-100-001 O:11 (F) 11 r e,n,x Salamae 00000-0110-110-000 00011-0110-110-000 San Diego 00000-0110-000-011 Schwarzengrund 00000-0110-110-001 00000-0110-010-001 O:4 (B) 1,4,12,27 d 1,7 Sendai 00101-0110-100-010 O:9 (D1) 1,9,12 a 1,5 Senftenberg 01110-0110-001-001 10100-0110-011-001 O:1,3,19 (E4) 1,3,19 g,[s],t - [z27],[z34],[z37],[z43],[z45],[z46],[z82] Stanley 01000-0110-110-101 O:4 (B) 1,4,[5],12,27 d 1,2 Tennessee 01100-0100-011-001 O:7 (C1) 6,7,14 z29 [1,2,7] Thompson 00000-0100-111-001 O:7 (C1) 6,7,14 k 1,5 [R1.....] Typhi 11101-0111-000-010 01101-0111-000-010 01001-0111-000-010 O:9 (D1) 9,12,[Vi] d - [z66] Typhimurium 11010-0110-111-101 11010-0110-111-001 O:4 (B) 1,4,[5],12 i 1,2 Typhimurium var. O 5 - (Copenhagen) 11010-0110-111-101 Uganda 01000-0110-000-011 O;3,10 (E1) 3,{10},{15} l,z13 1,5 Uganda var. O 15+ (Kinshasa) 01000-0110-000-011 Unknown (S-166) 00001-1101-011-101 00001-1101-011-101 Urbana 00000-0110-110-000 O:30 (N) 30 b e,n,x Vellore 00000-0110-100-101 O:4 (B 1,4,12,27 z10 z35 Virchow 01000-0110-101-001 O:7 (C1) 6,7,14 r 1,2 Vridi 00101-0100-000-001 O:13 (G) 1,13,23 e,h l,w Wandsworth 01000-0110-001-001 O:39(Q) 39 b 1,2 Weltevreden 00110-0110-110-001 10110-0111-110-001 00110-0110-110-001 O:3,10 (E1) 3,{10},{15} r z6 Worthington 00100-0111-011-001 O:13 (G) 1,13,23 z l,w [z43] GO TO TOP